Конфликт Хидзюцу – это игра о мире ниндзя из анимационного сериала «Наруто». Пять Скрытых деревень шиноби начинает очередную войну за власть и ресурсы, пока террористическая группа Акатсуки наблюдает за конфликтом из тени. Игроку предстоит выбрать героя из обширного списка анимешных персонажей, начать прокачивать его и участвовать в масштабных битвах против других ниндзя.
Все шиноби разделены на четыре природные стихии, специализации атаки или защиты, а также ближний или дальний бой. Каждый игрок выбирает себе персонажа по вкусу и активно прокачивает его навыки, зарабатывая очки опыта в динамичных сражениях. У всех персонажей свои особенности и уникальные дзюцу, способные дать преимущество в одной ситуации и стать обузой в другой.