В Baldi's Basics in Education оказавшись в учебном заведении пользователю необходимо в режиме ограниченного времени решать головоломки и искать полезные предметы. Задачи реализованы в различных степенях сложности, от простых к более замысловатым. Главным преподавателем в школе станет строгий профессор Балди, чьи методы изученья наук заметно отличаются от общепринятых. Ели геймер допустит на экзамене промашку, Балди придет в неописуемую ярость, после чего остается лишь спасаться бегством.       
Путешествуя по школьным локациям, главный герой встретится как с нейтральными, так и с враждебными персонажами, в том числе и с приведениями. Главная задача игрока – отыскать в аудиториях семь школьных блокнотов и продержаться как можно больше времени.